Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letm2Q7TNU7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms