Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stk40Q7TNL3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms