Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf139Q7TMV1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf139Q7TMV1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms