Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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