Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Vma21Q78T54 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Vma21Q78T54 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Vma21Q78T54 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vma21Q78T54 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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