Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms