Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme8Q715T0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms