Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms