Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms