Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms