Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms