Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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