Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Atp8b3Q6UQ17 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Atp8b3Q6UQ17 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Atp8b3Q6UQ17 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Atp8b3Q6UQ17 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Atp8b3Q6UQ17 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Atp8b3Q6UQ17 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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