Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9c1Q6UJY2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9c1Q6UJY2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms