Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms