Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms