Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms