Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms