Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms