Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvoplQ6PDF3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms