Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms