Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms