Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Herc4Q6PAV2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms