Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gapvd1Q6PAR5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gapvd1Q6PAR5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms