Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtminQ6P9S1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtminQ6P9S1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtminQ6P9S1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtminQ6P9S1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtminQ6P9S1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtminQ6P9S1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtminQ6P9S1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms