Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms