Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Senp6Q6P7W0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Senp6Q6P7W0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms