Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms