Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc8Q6NZB0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms