Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms