Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms