Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr44Q6NVE8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms