Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Amer3Q6NS69 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms