Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms