Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CltbQ6IRU5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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