Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt39Q6IFX4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt39Q6IFX4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms