Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms