Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms