Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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