Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BegainQ68EF6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BegainQ68EF6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms