Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms