Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna3Q65CL1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms