Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top2bQ64511 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms