Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms