Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Abcg1Q64343 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Abcg1Q64343 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Abcg1Q64343 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Abcg1Q64343 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Abcg1Q64343 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Abcg1Q64343 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Abcg1Q64343 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Abcg1Q64343 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Abcg1Q64343 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Abcg1Q64343 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Abcg1Q64343 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Abcg1Q64343 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcg1Q64343 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Abcg1Q64343 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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