Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms