Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift52Q62559 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift52Q62559 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift52Q62559 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift52Q62559 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift52Q62559 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms