Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms