Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms