Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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